سیمون دوازده ساله پس از تماشای مرگ بی‌رحمانه مادرش، احساس جدایی دردناکی از دنیا دارد. سیمون، یک هنرمند چندرسانه‌ای گوشه‌گیر در دهه بیست زندگی‌اش، در تلاش است تا حملات پانیک خردکننده‌اش را کنترل کند و شغل خود را در یک پارکینگ زیرزمینی حفظ کند. و سیمون، یک فیزیک‌دان شصت ساله، در حال ارائه کنفرانسی درباره ماهیت زمان است. زندگی این سه سیمون در یک فرادنیای هزارتوگونه به هم گره می‌خورد؛ جایی که بازه‌های زمانی با هم تداخل دارند، شخصیت‌ها تکثیر می‌شوند و خطوط داستانی تکرار و گسترش می‌یابند. اما فیلم اندورفین با وجود تمام رفت‌وآمدهایش در طول زمان، همچنان در زندگی درونی سیمون‌ها ریشه دارد؛ یک بررسی هنری از پدیده‌های علمی که به شکلی تاثیرگذار به چگونگی مواجهه انسان‌ها با تروما می‌پردازد.